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針對我國啤酒、酵母、腐乳、醬油、食醋等優勢傳統食品產業，選擇釀酒酵母、異常畢赤酵母、熱帶假絲酵母、卷曲狀毛霉、米曲霉、黑曲霉、紫色紅曲菌、谷氨酸棒桿菌、巴氏醋桿菌、科氏梭菌等10種重要生產用菌種，以表型特征、系統發育特征和基因型特征技術為基礎，分別開展了10個菌種的分類體系及鑒定評價技術方法的研究。
通過開展10個菌種的分類學體系的研究，明確了我國優勢傳統食品10個生產常用菌種分類學地位，為澄清菌種名稱的誤用、同物異名或異物同名提供科學依據。研究初步建立了以核酸序列分析方法（26S rDNA D1/D2區基因片段）為主，結合生理生化特征分析、形態學特征分析以及Biolog自動微生物分析系統的釀酒酵母、熱帶假絲酵母、異常畢赤酵母菌種的種水平多相鑒定技術方法。初步建立了以菌種的培養特征、顯微形態為主要依據，結合核酸序列分析技術（ITS1-5.8S-ITS2區基因片段）、功能基因分析技術和Biolog微生物自動鑒定系統的卷曲狀毛霉、米曲霉、黑曲霉、紫色紅曲菌的種水平多相鑒定技術方法。初步建立了以核酸序列分析方法（16S rDNA基因片段）為主，結合功能基因分析技術、生理生化特征分析、形態學特征分析以及Biolog自動微生物分析系統的谷氨酸棒桿菌、巴氏醋桿菌、科氏梭菌的種水平多相鑒定技術方法。
該項研究獲得了國家 “十一五”科技支撐計劃項目“優勢傳統食品產業菌種鑒定評價技術和安全管理體系”(2007BAK36B06)的資助，目前研究工作進展順利，已初步制定了“食品生產用釀酒酵母菌種鑒定技術規程”等10個菌種的鑒定評價技術規程標準草稿，規定了食品生產用菌種鑒定及適用范圍，術語與定義，菌種的鑒定原則，鑒定流程，操作步驟以及結果的評價等內容，目前標準草稿正在進一步修改完善當中。下一步研究計劃將進一步完善菌種鑒定評價技術方法，修改補充菌種鑒定技術規程標準。該項研究成果將為我國優勢傳統食品產業菌種鑒定評價技術水平的全面提升提供了有力支撐。
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